avatar
Articles
12
Tags
9
Categories
5
主页
搜索
分类
关于
LogoJinhengHao的博客wormlab3.0使用介绍 Back to Home
主页
搜索
分类
关于

wormlab3.0使用介绍

Created2025-08-15|Updated2025-08-18|湿实验相关
|Post Views:|Comments:

https://www.youtube.com/watch?v=OdZGgVD_iv4

视频转载自油管,并使用deepseek自动进行翻译k自动进行翻译

Author: Jinheng Hao
Link: https://www.jinhenghaoblog.top/posts/20250815193333.html
Copyright Notice: All articles on this blog are licensed under CC BY-NC-SA 4.0 unless otherwise stated.
Previous
windows下基于anaconda的开源版pymol的安装
安装pymol时用的是win7,也能适用于win10,只不过我主机已经安装了,这里是开了个虚拟机演示。 Unofficial Windows Binaries for Python Extension Packages地址(用于下载pymol包):https://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/链接挂掉了,但是可以通过github的release进入下载 Anaconda官网:https://www.anaconda.com/ 如果使用pip命令出现无法安装的问题,视情况而解决,不过很有可能只是需要更换为国内镜像就可以了,在这里提供一个临时调用镜像源的命令(这里的some-package指的是包的文件,比如pymol-2.6.0a0-cp38-cp38-win_amd64.whl): pip install some-package -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple/ win版本的gromacs安装,对于win7用户来说,设置环境变量也是一样,只不过在搜索那里改成“环境变量”——...
Next
基于AutoDock-Vina的小分子并行对接
需求:有一个需要用一种受体对八千多个小分子对接的任务,故写下此脚本。 对接数据如下: 不同名称的中药 其中一种中药含有的各种成分,已经通过 prepare_receptor4.py 批量转换为 pdbqt 文件 对接脚本如下,放到不同中药文件夹的目录下运行即可(linux): 1234567891011121314151617181920212223242526272829303132333435363738394041424344454647484950515253545556575859606162# -*- coding: utf-8 -*-"""Created on *********@author: 真弓快车该脚本的目的是检查因为异常而未能对接成功的分子,再批量对接example:vina --ligand ./*/*.pdbqt --out result.pdbqt --config 2oxe.conf > result.log"""import osimport sysfrom joblib im...

Comments
avatar
Jinheng Hao
生信/实验/技术交流
Articles
12
Tags
9
Categories
5
Follow Me
Announcement
如果你对内容有什么疑问,请积极评论
Recent Posts
R语言基础语法学习记录2025-08-18
使用hexo-pro新建文章时出现TypeError: __permalink.startsWith is not a function2025-08-18
hexo-butterfly博客搜索功能的实现2025-08-17
windows下基于anaconda的开源版pymol的安装2025-08-15
wormlab3.0使用介绍2025-08-15
© 2025 By Jinheng HaoFramework Hexo 7.3.0|Theme Butterfly 5.4.3