基于David数据库与微生信平台进行Go-KEGG分析
进入DAVID数据库
选择Functional Annotation
点击Functional Annotation Tool
选择GO与PathWays
GO这里选择BP、CC、MF
点击Chart可看到：
点击下载文件，将数据复制粘贴到EXCEL中备用。
其余的CC、MF也是同样的操作
PATHWAY这里我们只选择KEGG进行下载，也是点击Chart，下载文件并整理到excel中备用。
整理从DAVID数据库下载的文件
一般下载下来的表格如图所示：
在这里分了4个Sheet，每个Sheet对应着从不同地方搜集下来的数据，分为BP、CC、MF、KEGG
三合一图作法
三合一的图需要以下格式：
只取Term和PValue的值，其中Term需要去除前面GO：xxxx的数值，留下后面的信号通路名字
同样的道理，分别搜集BP、CC、MF并累积到一个Sheet中，如图所示：
subgroup与Enrichment Score需要自己手动创建，其中subgroup对应的就是你搜集下来的数据是属于BP还是CC亦或者是MF。需要作一个提前标识。而Enrichment Score列实则上是由 -log10(PValue) 而来，在excel中设立公式，并ctrl左键拉动自动计算即可：
打开微生信
选择三合一功能
直接复制粘贴进去，按照自己的要求调整参数，并提交任务
最后输出图：
富集分析图画法
这里点入KEGG，并对数据作提前处理：
这里选择Term、FDR、PValue、Count列进行整理。
然后打开微生信平台
选择富集气泡图
直接复制粘贴进去，按照自己的要求调整参数，并提交任务
最后输出图：
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