手把手教你快速完成 C.elegans qPCR 引物设计

发表于2025-11-25|更新于2025-11-25

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下载C.elegans目标基因序列

在WormBase（https://wormbase.org/#012-34-5）搜索所需要的基因

点击这个框，往下拉，注意type上写cDNA的才是我们所要的

这块就是我们的目标基因，复制保存为fasta文件，其他基因同样也是这个步骤进行复制

使用Primer-BLAST设计引物

进入ncbi官网（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/）点击右栏的Blast，拉到下面

点击Primer-BLAST

粘贴序列

设置引物的长度

注：秀丽隐杆线虫在ncbi里面是nematodes (taxid:6231)

选择物种和形式

设置完后点击Get Primers

稍等一会后我们会获得结果

需要注意的是，引物Tm值在55-65%，引物GC%在40-60%，引物长度18-25nt之间，即为理想的引物

点击Download primer pairs即可下载引物列表

之后拿去做qpcr即可

秀丽隐杆线虫基因测序

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